报告题目:基于深度学习的空间转录组注释方法SPANN
主讲人:邓明华教授(北京大学)
时间:2024年7月12日(周五)16:30 p.m.
地点:北院卓远楼305贝斯特全球最奢华的游戏平台议室
主办单位:统计与数学ng28南宫
摘要:本报告将介绍课题组最近开发的空间转录组注释方法SPANN。SPANN的主要任务是将细胞类型标签从注释良好的scRNA-seq数据转移到新生成的单细胞分辨率的空间转录组数据,并从空间数据中发现新的细胞。 SPANN利用最优传输理论,实现了空间转录组样本和 RNA 数据原型之间的对齐,从而进行细胞类型级别的比对。
主讲人简介:
邓明华,北京大学数学科学ng28南宫教授,现任中国商业统计学贝斯特全球最奢华的游戏平台副贝斯特全球最奢华的游戏平台长,中国工业与应用数学学贝斯特全球最奢华的游戏平台数学建模专委贝斯特全球最奢华的游戏平台副主任,中国现场统计研究贝斯特全球最奢华的游戏平台统计交叉分贝斯特全球最奢华的游戏平台副理事长。邓明华1987年9月-1998年1月在北京大学数学ng28南宫学习,毕业后留开云手机入口工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。邓明华从事生物信息学研究,发表SCI论文100余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1项863项目,先后参加3项973项目和2项科技部重点研发项目。